软件沼气池设备的定期保护和维护是发挥沼气工程效益的重要环节。 部分沼气工程建成后，由于保护管理不当，沼气工程无法运行，应加强设备的保护和维护。
(1) 格栅
格栅应定期检查维护，损坏的应及时更换。 机械格栅机运行后应及时清洗格栅机。
(2) 泵房
①每次停泵后，检查填料或油封的密封情况，进行处理，根据需要添加或更换填料、润滑油和润滑脂。
②至少每六个月检查、调整和更换水泵进出口闸阀和填料一次。
③集水坑的水位计或液位计及其转换设备应定期检修。
④备用泵应至少每月测试一次。 当环境温度低于 0°C 时，将泵壳内储存的水排出。
(3) 调理池
①连接贮水池的管道应排列整齐。
②调理罐每年应清空清洗一次，并及时清除泥沙和杂物。
③正常运行后，每年排泥1~2次，排泥阀应经常检查和维护。
(4) 厌氧反应器
①厌氧反应器的塔体、各种管道和闸阀应每年检查维修一次。
②厌氧反应器的各种加热设备要经常除垢和清洗。
③使用换热器供热时，管道和闸阀处的密封材料应每年更换一次。
④使用螺旋桨等机械搅拌时，应定期检查轴承，加注润滑油，并经常检查和拧紧支撑架的连接螺栓。
⑤蒸汽管道和沼气管道中的冷凝水应按规划规定定期排放。
⑥寒冷地区冬季，溢流管和防爆设备的水封要做好设备和管道的保温和防冻工作。
⑦厌氧反应器应每3～5年清洗和维修一次。
(5) 沼气储罐
①定期检查沼气储罐、沼气管道、闸阀有无漏气现象。
②沼气池表面的油漆或涂料应定期重新粉刷。
③沼气池的起重设施，包括进出水阀门，应经常检查，并加注润滑油（脂）。
④冷季前应检修沼气池水封的防冻设施。
⑤ 储气罐的储水每六个月更换一次。
⑥沼气储气罐运行后每3～5年应维修一次，使用期限届满须更换气阀。
⑦沼气报警设备应每年检修一次。
(6)沼气净化设备
①定期检查沼气净化系统的气密性，每周开闭旁通阀和备用脱硫塔阀门。
②定期清扫沼气净化设备内的冷凝水。
③根据设备要求定期更换脱硫剂。
